22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1946 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  42.09 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  40.68 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  41.79 
 
 
295 aa  205  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  40.91 
 
 
283 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  37.6 
 
 
314 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  35.59 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  34.49 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  32.97 
 
 
300 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  35.61 
 
 
298 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  32.47 
 
 
319 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  35.4 
 
 
283 aa  155  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  33.46 
 
 
296 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  33.81 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  33.81 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  31.72 
 
 
303 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  31.53 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  22.26 
 
 
453 aa  75.9  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  21.6 
 
 
444 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  23.35 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3741  hypothetical protein  21.78 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0732903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>