22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0274 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  72.41 
 
 
319 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  72.51 
 
 
336 aa  428  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  57.76 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  52.9 
 
 
300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  51.7 
 
 
303 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  53.04 
 
 
298 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  47.35 
 
 
281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  43.9 
 
 
283 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  42.96 
 
 
283 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  36.86 
 
 
299 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  39.93 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  39.93 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  38.49 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  35.59 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  32.57 
 
 
283 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  33.21 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  30.3 
 
 
280 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 
453 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 
444 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  25.22 
 
 
428 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  27.27 
 
 
217 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>