22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4156 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  46.79 
 
 
295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  42.96 
 
 
328 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  42.64 
 
 
296 aa  212  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  40.91 
 
 
299 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  41.57 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  38.11 
 
 
300 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  40.98 
 
 
298 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  40.75 
 
 
283 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  40.82 
 
 
303 aa  188  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  37.32 
 
 
319 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  37.23 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  38.06 
 
 
283 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  38.2 
 
 
285 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  38.2 
 
 
285 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  40.07 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  35.45 
 
 
280 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  31.11 
 
 
299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 
453 aa  90.1  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 
444 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  23.4 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  27.06 
 
 
428 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>