23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1295 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  58.39 
 
 
283 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  47.35 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  45.39 
 
 
285 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  45.39 
 
 
285 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  43.82 
 
 
319 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  43.46 
 
 
336 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  43.3 
 
 
299 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  43.87 
 
 
296 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  41.84 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  41.39 
 
 
300 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  42.49 
 
 
298 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  37.18 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  37.23 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  33.45 
 
 
299 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  32.83 
 
 
283 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  29 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  31.7 
 
 
453 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 
444 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  27.76 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  23.56 
 
 
217 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5392  hypothetical protein  26.46 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>