20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33330  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  302  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.592597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0622  hypothetical protein  55.07 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3158  hypothetical protein  58.33 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.15063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3369  hypothetical protein  54.24 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2773  hypothetical protein  68.18 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.0000100845 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0123  hypothetical protein  43.37 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2222  hypothetical protein  56.14 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659123  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0327  hypothetical protein  62.22 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.163923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0217  hypothetical protein  49.09 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5322  hypothetical protein  63.64 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127738  normal  0.508223 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1294  hypothetical protein  45.61 
 
 		 95 aa  50.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18170  hypothetical protein  51.67 
 
 		 77 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0316  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201172  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4036  hypothetical protein  57.78 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0125  hypothetical protein  53.06 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00206742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0488  hypothetical protein  51.72 
 
 		 78 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4418  hypothetical protein  56.82 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0595  hypothetical protein  47.37 
 
 		 89 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5867  hypothetical protein  54.76 
 
 		 42 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.539151  normal  0.215251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1979  hypothetical protein  66.67 
 
 		 86 aa  40.8  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>