26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4036 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4036  hypothetical protein  100 
 
 
57 aa  110  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968027  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4418  hypothetical protein  90.74 
 
 
55 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0217  hypothetical protein  66 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5867  hypothetical protein  73.81 
 
 
42 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.539151  normal  0.215251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0316  hypothetical protein  61.36 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201172  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5189  hypothetical protein  50.94 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221064  decreased coverage  0.0000618918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4802  hypothetical protein  50.94 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4888  hypothetical protein  50.94 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3158  hypothetical protein  57.41 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.15063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5404  hypothetical protein  55.56 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2773  hypothetical protein  59.09 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.0000100845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0622  hypothetical protein  60 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0595  hypothetical protein  51.79 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0049  hypothetical protein  57.78 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13686  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.34573e-46  normal  0.1222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33330  hypothetical protein  57.78 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.592597  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0327  hypothetical protein  54.35 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.163923  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5322  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127738  normal  0.508223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3369  hypothetical protein  52.83 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0123  hypothetical protein  51.11 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0488  hypothetical protein  64.44 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1294  hypothetical protein  43.86 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18170  hypothetical protein  53.33 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2222  hypothetical protein  47.73 
 
 
72 aa  42.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659123  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0125  hypothetical protein  52.27 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00206742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1979  hypothetical protein  57.41 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>