19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0622 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0622  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  197  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3158  hypothetical protein  65 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.15063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3369  hypothetical protein  67.24 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2773  hypothetical protein  66.67 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.0000100845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0327  hypothetical protein  66.67 
 
 
61 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.163923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33330  hypothetical protein  56.86 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.592597  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2222  hypothetical protein  55.36 
 
 
72 aa  52.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659123  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0316  hypothetical protein  52.17 
 
 
90 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201172  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4036  hypothetical protein  60 
 
 
57 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968027  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0217  hypothetical protein  54.35 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4418  hypothetical protein  56.6 
 
 
55 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495786 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5322  hypothetical protein  52.27 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127738  normal  0.508223 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1294  hypothetical protein  46.43 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0595  hypothetical protein  43.06 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18170  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5867  hypothetical protein  59.52 
 
 
42 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.539151  normal  0.215251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0125  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00206742  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0123  hypothetical protein  37.93 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5404  hypothetical protein  43.4 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>