23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5322 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5322  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127738  normal  0.508223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0316  hypothetical protein  49.3 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201172  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0125  hypothetical protein  54.72 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00206742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33330  hypothetical protein  61.7 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.592597  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0622  hypothetical protein  51.06 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2773  hypothetical protein  49.02 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.0000100845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4418  hypothetical protein  54 
 
 
55 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4036  hypothetical protein  55.1 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968027  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0595  hypothetical protein  59.09 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2222  hypothetical protein  38.46 
 
 
72 aa  47  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659123  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3158  hypothetical protein  48.89 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.15063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5867  hypothetical protein  58.54 
 
 
42 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.539151  normal  0.215251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0217  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5189  hypothetical protein  44.68 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221064  decreased coverage  0.0000618918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3369  hypothetical protein  46.67 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4888  hypothetical protein  44.68 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4802  hypothetical protein  44.68 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18170  hypothetical protein  54.55 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0049  hypothetical protein  45.83 
 
 
58 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0123  hypothetical protein  48 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5404  hypothetical protein  45.83 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1294  hypothetical protein  42.55 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0327  hypothetical protein  37.04 
 
 
61 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.163923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>