19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2222 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2222  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659123  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1294  hypothetical protein  45.83 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3369  hypothetical protein  58.18 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33330  hypothetical protein  56.36 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.592597  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3158  hypothetical protein  58.7 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.15063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0622  hypothetical protein  55.36 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0123  hypothetical protein  36.99 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2773  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.0000100845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0327  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.163923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0125  hypothetical protein  55.1 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00206742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18170  hypothetical protein  42.67 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5322  hypothetical protein  48.94 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127738  normal  0.508223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0316  hypothetical protein  40.38 
 
 
90 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201172  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4036  hypothetical protein  47.73 
 
 
57 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968027  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5189  hypothetical protein  42.11 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221064  decreased coverage  0.0000618918 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4888  hypothetical protein  42.11 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4802  hypothetical protein  42.11 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4418  hypothetical protein  47.73 
 
 
55 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5404  hypothetical protein  43.86 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>