19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5867 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5867  hypothetical protein  100 
 
 
42 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.539151  normal  0.215251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4036  hypothetical protein  73.81 
 
 
57 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968027  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4418  hypothetical protein  73.81 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13686  hypothetical protein  59.52 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.34573e-46  normal  0.1222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0316  hypothetical protein  54.76 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201172  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5404  hypothetical protein  54.76 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4888  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5189  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221064  decreased coverage  0.0000618918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4802  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0217  hypothetical protein  59.52 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5322  hypothetical protein  57.14 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127738  normal  0.508223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0622  hypothetical protein  59.52 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0595  hypothetical protein  52.38 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0049  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33330  hypothetical protein  54.76 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.592597  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2773  hypothetical protein  52.38 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.0000100845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3158  hypothetical protein  52.38 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.15063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0327  hypothetical protein  52.38 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.163923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3369  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>