27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1979 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1979  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0217  hypothetical protein  64.29 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0595  hypothetical protein  58.33 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4802  hypothetical protein  58.33 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4888  hypothetical protein  58.33 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5404  hypothetical protein  46.58 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5189  hypothetical protein  58.33 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221064  decreased coverage  0.0000618918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0049  hypothetical protein  58.33 
 
 
58 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4036  hypothetical protein  57.41 
 
 
57 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0316  hypothetical protein  60.42 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201172  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4418  hypothetical protein  59.18 
 
 
55 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33330  hypothetical protein  66.67 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.592597  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13686  hypothetical protein  52.08 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.34573e-46  normal  0.1222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2773  hypothetical protein  59.57 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.0000100845 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5322  hypothetical protein  56.25 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127738  normal  0.508223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0488  hypothetical protein  75.56 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5867  hypothetical protein  58.54 
 
 
42 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.539151  normal  0.215251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3905  hypothetical protein  50.98 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4834  hypothetical protein  61.54 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0125  hypothetical protein  53.33 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00206742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0622  hypothetical protein  48.48 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3158  hypothetical protein  47.37 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.15063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0123  hypothetical protein  52.17 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0327  hypothetical protein  46.94 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.163923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3369  hypothetical protein  41.54 
 
 
97 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0732  hypothetical protein  49.21 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.147899  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18170  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>