21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28140 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1003    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2535  PE-PGRS family protein  44.35 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0736  PE-PGRS family protein  39.29 
 
 		 405 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  32.86 
 
 		 438 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  31.83 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0675  hypothetical protein  30.34 
 
 		 460 aa  107  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.825925  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  31.61 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  31.56 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3585  hypothetical protein  34.55 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  28.57 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  30.67 
 
 		 787 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3997  hypothetical protein  31.51 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0332609  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3015  hypothetical protein  32.12 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195968  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0833  hypothetical protein  23.88 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  45.12 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  33.79 
 
 		 529 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04950  hypothetical protein  28.68 
 
 		 402 aa  50.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0458  hypothetical protein  33.33 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000295083  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0382  hypothetical protein  37.67 
 
 		 410 aa  43.9  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0654  hypothetical protein  45.71 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  38.24 
 
 		 615 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>