26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1086 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  846    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  77.88 
 
 
437 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04460  hypothetical protein  39.59 
 
 
432 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  34.31 
 
 
492 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  38.59 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  26.3 
 
 
787 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  32.64 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  41.67 
 
 
595 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  30.65 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3997  hypothetical protein  45.97 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0332609  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0736  PE-PGRS family protein  39.13 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3585  hypothetical protein  30.15 
 
 
422 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2535  PE-PGRS family protein  35.58 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  28.52 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0382  hypothetical protein  25.49 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0656  hypothetical protein  27.09 
 
 
527 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07760  hypothetical protein  48.05 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0654  hypothetical protein  36.76 
 
 
495 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  26.73 
 
 
530 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0675  hypothetical protein  25 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.825925  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1245  hypothetical protein  26.87 
 
 
553 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537761  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0833  hypothetical protein  28.39 
 
 
457 aa  47  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  28.21 
 
 
621 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04950  hypothetical protein  28.87 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3015  hypothetical protein  43.3 
 
 
417 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195968  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1365  hypothetical protein  29.2 
 
 
508 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.113149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>