25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2575 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  58.29 
 
 
595 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  52.99 
 
 
529 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0656  hypothetical protein  43.16 
 
 
527 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1245  hypothetical protein  45.25 
 
 
553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537761  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  29 
 
 
438 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  32.75 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  31.37 
 
 
437 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  31.58 
 
 
530 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  32.83 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3585  hypothetical protein  31.19 
 
 
422 aa  84  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0382  hypothetical protein  34.44 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  27.25 
 
 
787 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3997  hypothetical protein  32.42 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0332609  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2535  PE-PGRS family protein  37.87 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  28.16 
 
 
539 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3015  hypothetical protein  46.53 
 
 
417 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195968  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0654  hypothetical protein  38.2 
 
 
495 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07760  hypothetical protein  43.04 
 
 
424 aa  57.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  35.76 
 
 
621 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24130  hypothetical protein  34.09 
 
 
487 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451459  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0675  hypothetical protein  34.06 
 
 
460 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.825925  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04460  hypothetical protein  30.96 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1269  hypothetical protein  34.62 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0914584  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0736  PE-PGRS family protein  38.75 
 
 
405 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>