28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0063 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1135    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  56.97 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0656  hypothetical protein  46.75 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  50.79 
 
 		 529 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1245  hypothetical protein  45.1 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537761  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  30.44 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  33.05 
 
 		 530 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  32.62 
 
 		 437 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  32.74 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0382  hypothetical protein  34.15 
 
 		 410 aa  92  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3585  hypothetical protein  32 
 
 		 422 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  31.21 
 
 		 787 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2535  PE-PGRS family protein  42.51 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3997  hypothetical protein  32.87 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0332609  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  32.99 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0654  hypothetical protein  38.54 
 
 		 495 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  35.63 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  36.72 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04460  hypothetical protein  32.09 
 
 		 432 aa  55.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24130  hypothetical protein  33.99 
 
 		 487 aa  54.7  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1269  hypothetical protein  29.09 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0914584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5976  hypothetical protein  34.53 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0736  PE-PGRS family protein  50.94 
 
 		 405 aa  50.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21393  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0675  hypothetical protein  25.7 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.825925  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07760  hypothetical protein  41.03 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3015  hypothetical protein  40.86 
 
 		 417 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195968  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0458  hypothetical protein  25.71 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000295083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4421  hypothetical protein  35.26 
 
 		 396 aa  43.9  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>