21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4421 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4421  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  34.68 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  40 
 
 		 422 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  39.37 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  37.7 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  35.42 
 
 		 595 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  32.38 
 
 		 787 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1245  hypothetical protein  34.04 
 
 		 553 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537761  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0656  hypothetical protein  31.95 
 
 		 527 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  31.98 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  37.76 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3585  hypothetical protein  33.02 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  29.75 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  33.53 
 
 		 539 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0382  hypothetical protein  46.94 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0675  hypothetical protein  29.06 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.825925  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04460  hypothetical protein  31.35 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  37.35 
 
 		 621 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3997  hypothetical protein  35.62 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0332609  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0654  hypothetical protein  41.59 
 
 		 495 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1269  hypothetical protein  33.88 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0914584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>