18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04950  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  746    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  41.09 
 
 		 621 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1365  hypothetical protein  33.24 
 
 		 508 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.113149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  32.2 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10973  integral membrane protein  31.49 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0198521  normal  0.799672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3306  hypothetical protein  32.49 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4858  hypothetical protein  31.37 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127586  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1873  hypothetical protein  30.9 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  30.26 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1269  hypothetical protein  32.2 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0914584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  31.54 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4701  hypothetical protein  29.19 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4407  hypothetical protein  30.23 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4321  hypothetical protein  30.23 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  33.09 
 
 		 530 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  32.88 
 
 		 539 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3015  hypothetical protein  32.35 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195968  normal  0.0142296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>