20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3108 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3108  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.511175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0912  hypothetical protein  99.07 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0736534  normal  0.630086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3202  hypothetical protein  96.26 
 
 		 214 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3632  hypothetical protein  85.51 
 
 		 237 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0996  hypothetical protein  73.71 
 
 		 212 aa  338  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.708281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1053  hypothetical protein  73.3 
 
 		 210 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383319  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0984  hypothetical protein  68.22 
 
 		 210 aa  315  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.873702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1086  hypothetical protein  68.22 
 
 		 210 aa  315  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3305  hypothetical protein  67.76 
 
 		 210 aa  315  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0523546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0971  hypothetical protein  53.95 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0344388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0886  hypothetical protein  51.43 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1021  hypothetical protein  52.5 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0869  hypothetical protein  52.91 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2812  hypothetical protein  53.69 
 
 		 205 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.14111  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4333  hypothetical protein  27.86 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003008  hypothetical protein  28.84 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02893  hypothetical protein  27.98 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1597  hypothetical protein  27.32 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2255  hypothetical protein  25.81 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  35.19 
 
 		 290 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>