18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02893 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02893  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003008  hypothetical protein  76 
 
 
196 aa  301  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1597  hypothetical protein  52.3 
 
 
196 aa  201  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2255  hypothetical protein  43.18 
 
 
193 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1053  hypothetical protein  29.08 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383319  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3202  hypothetical protein  28.5 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.957378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3108  hypothetical protein  27.98 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.511175  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3305  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0523546  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0984  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.873702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1086  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0912  hypothetical protein  27.46 
 
 
214 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0736534  normal  0.630086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3632  hypothetical protein  26.42 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0996  hypothetical protein  26.8 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.708281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0869  hypothetical protein  27.37 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0971  hypothetical protein  26.98 
 
 
209 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0344388  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2812  hypothetical protein  27.03 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.14111  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1021  hypothetical protein  26.04 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0886  hypothetical protein  24.74 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>