20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0869 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0869  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1021  hypothetical protein  60.1 
 
 
217 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0971  hypothetical protein  59.61 
 
 
209 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0344388  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0886  hypothetical protein  51.21 
 
 
209 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215531  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0984  hypothetical protein  55.67 
 
 
210 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.873702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1086  hypothetical protein  55.67 
 
 
210 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3305  hypothetical protein  55.15 
 
 
210 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0523546  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1053  hypothetical protein  54.64 
 
 
210 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2812  hypothetical protein  52.2 
 
 
205 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.14111  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3632  hypothetical protein  52.66 
 
 
237 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0996  hypothetical protein  52.45 
 
 
212 aa  228  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.708281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3108  hypothetical protein  53.65 
 
 
214 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.511175  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0912  hypothetical protein  53.12 
 
 
214 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0736534  normal  0.630086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3202  hypothetical protein  53.12 
 
 
214 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.957378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4333  hypothetical protein  32.06 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003008  hypothetical protein  29.25 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02893  hypothetical protein  27.37 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1597  hypothetical protein  26.87 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2255  hypothetical protein  24.88 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  23.6 
 
 
401 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>