20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2255 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2255  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003008  hypothetical protein  44.09 
 
 
196 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02893  hypothetical protein  43.18 
 
 
185 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1597  hypothetical protein  44.44 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0886  hypothetical protein  29.72 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215531  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3632  hypothetical protein  26.32 
 
 
237 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3305  hypothetical protein  27.36 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0523546  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1086  hypothetical protein  27.36 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0984  hypothetical protein  27.36 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.873702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1053  hypothetical protein  26.87 
 
 
210 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0869  hypothetical protein  24.88 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0971  hypothetical protein  26.94 
 
 
209 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0344388  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2812  hypothetical protein  27.14 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.14111  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0996  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.708281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3108  hypothetical protein  25 
 
 
214 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.511175  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0912  hypothetical protein  25 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0736534  normal  0.630086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4333  hypothetical protein  24.06 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3202  hypothetical protein  24.87 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.957378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1021  hypothetical protein  25.71 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0560  outer membrane insertion C-terminal signal  24.16 
 
 
206 aa  41.6  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>