19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3632 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3632  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  494  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3202  hypothetical protein  87.85 
 
 		 214 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0912  hypothetical protein  85.98 
 
 		 214 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0736534  normal  0.630086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3108  hypothetical protein  85.51 
 
 		 214 aa  370  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.511175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0996  hypothetical protein  71.96 
 
 		 212 aa  331  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.708281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1053  hypothetical protein  72.77 
 
 		 210 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383319  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0984  hypothetical protein  72.77 
 
 		 210 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.873702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1086  hypothetical protein  72.77 
 
 		 210 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3305  hypothetical protein  72.25 
 
 		 210 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0523546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0971  hypothetical protein  51.63 
 
 		 209 aa  238  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0344388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1021  hypothetical protein  52.13 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0869  hypothetical protein  52.66 
 
 		 203 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0886  hypothetical protein  48.1 
 
 		 209 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2812  hypothetical protein  51.63 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.14111  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4333  hypothetical protein  29.47 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003008  hypothetical protein  28.92 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02893  hypothetical protein  26.42 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1597  hypothetical protein  28.11 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2255  hypothetical protein  26.32 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>