18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0886 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0971  hypothetical protein  54.55 
 
 		 209 aa  258  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0344388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0869  hypothetical protein  51.21 
 
 		 203 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0984  hypothetical protein  54.69 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.873702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1086  hypothetical protein  54.69 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3305  hypothetical protein  54.17 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0523546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1021  hypothetical protein  54.21 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2812  hypothetical protein  53.73 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.14111  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1053  hypothetical protein  54.17 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0912  hypothetical protein  51.43 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0736534  normal  0.630086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3108  hypothetical protein  51.43 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.511175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3202  hypothetical protein  51.9 
 
 		 214 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0996  hypothetical protein  51.4 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.708281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3632  hypothetical protein  48.1 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4333  hypothetical protein  32.31 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2255  hypothetical protein  29.72 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003008  hypothetical protein  27.23 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02893  hypothetical protein  24.74 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>