15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3321 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3321  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  360  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0805  hypothetical protein  98.86 
 
 
181 aa  357  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.328617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3218  hypothetical protein  98.86 
 
 
181 aa  357  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0962  hypothetical protein  89.08 
 
 
174 aa  327  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0827  hypothetical protein  68.6 
 
 
178 aa  247  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0744  hypothetical protein  67.63 
 
 
177 aa  246  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0925  hypothetical protein  67.05 
 
 
175 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2954  hypothetical protein  55.21 
 
 
182 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0995258 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0488  putative lipoprotein  51.98 
 
 
184 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0599  membrane protein  50.85 
 
 
183 aa  160  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01155  hypothetical protein  39.53 
 
 
179 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004274  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  38.73 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0755  membrane protein  34.27 
 
 
178 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3499  hypothetical protein  31.48 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000916771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3568  hypothetical protein  39.02 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>