15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3218 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3218  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0805  hypothetical protein  97.79 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.328617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3321  hypothetical protein  98.86 
 
 		 175 aa  357  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0962  hypothetical protein  87.93 
 
 		 174 aa  324  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0827  hypothetical protein  68.6 
 
 		 178 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0925  hypothetical protein  67.05 
 
 		 175 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0744  hypothetical protein  67.63 
 
 		 177 aa  245  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2954  hypothetical protein  55.83 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0995258 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0488  putative lipoprotein  51.98 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0599  membrane protein  50.85 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01155  hypothetical protein  40.12 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004274  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  39.31 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0755  membrane protein  34.83 
 
 		 178 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3499  hypothetical protein  30.86 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000916771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3568  hypothetical protein  37.8 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>