15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3568 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3568  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3499  hypothetical protein  93.79 
 
 		 177 aa  347  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000916771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0744  hypothetical protein  34.58 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0488  putative lipoprotein  40.54 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0925  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004274  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  37.04 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01155  hypothetical protein  37.04 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0962  hypothetical protein  39.51 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0805  hypothetical protein  39.02 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.328617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3321  hypothetical protein  39.02 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0599  membrane protein  32.38 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3218  hypothetical protein  37.8 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0827  hypothetical protein  32.14 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0755  membrane protein  34.18 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2954  hypothetical protein  37.1 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0995258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>