15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0962 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0962  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0805  hypothetical protein  89.08 
 
 		 181 aa  328  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.328617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3321  hypothetical protein  89.08 
 
 		 175 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3218  hypothetical protein  87.93 
 
 		 181 aa  324  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0925  hypothetical protein  65.32 
 
 		 175 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0827  hypothetical protein  65.7 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0744  hypothetical protein  65.9 
 
 		 177 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2954  hypothetical protein  53.99 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0995258 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0488  putative lipoprotein  52.1 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0599  membrane protein  50.28 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01155  hypothetical protein  37.43 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004274  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  36.67 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0755  membrane protein  34.83 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3499  hypothetical protein  30.41 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000916771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3568  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>