29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2089 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2089  SrpA-related protein  100 
 
 		 465 aa  908    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.885668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2585  SrpA-related protein  49 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611843  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2020  SrpA-related protein  41.49 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.511866  normal  0.928419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2090  SrpA-related protein  47.23 
 
 		 717 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1888  SrpA-related protein  47.23 
 
 		 717 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2439  srpA-related protein  53.11 
 
 		 716 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1943  protein-glutamate O-methyltransferase  45.19 
 
 		 740 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.63049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1929  SrpA-related protein  52.91 
 
 		 598 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2316  protein-glutamate O-methyltransferase  53.11 
 
 		 814 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2029  protein-glutamate O-methyltransferase  52.54 
 
 		 833 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1853  hypothetical protein  50.58 
 
 		 594 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1777  SrpA-related protein  59.06 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2194  hypothetical protein  38.87 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4228  hypothetical protein  52.38 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2751  hypothetical protein  53.23 
 
 		 238 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00712374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4082  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03991  hypothetical protein  50.94 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0215  hypothetical protein  50.96 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0096  hypothetical protein  48.76 
 
 		 236 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3133  hypothetical protein  49.12 
 
 		 300 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0608  hypothetical protein  45.95 
 
 		 273 aa  91.3  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.195723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2219  hypothetical protein  45.87 
 
 		 210 aa  89.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0518  hypothetical protein  38.86 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0738  hypothetical protein  37.4 
 
 		 201 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00987053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1783  hypothetical protein  41.33 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0031  hypothetical protein  42.45 
 
 		 138 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1787  hypothetical protein  40.6 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0135  hypothetical protein  42.76 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1538  hypothetical protein  42.73 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.304444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>