33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0031 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0031  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  279  8.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0518  hypothetical protein  54.13 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2751  hypothetical protein  52.76 
 
 
238 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00712374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2219  hypothetical protein  50.94 
 
 
210 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0608  hypothetical protein  49.6 
 
 
273 aa  110  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.195723  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4228  hypothetical protein  51.43 
 
 
333 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3133  hypothetical protein  50.93 
 
 
300 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03991  hypothetical protein  50 
 
 
327 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0096  hypothetical protein  50.86 
 
 
236 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4082  hypothetical protein  52.08 
 
 
244 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0738  hypothetical protein  43.7 
 
 
201 aa  99.4  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00987053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1853  hypothetical protein  48.62 
 
 
594 aa  97.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1787  hypothetical protein  49.5 
 
 
193 aa  97.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2031  SrpA-related protein  46.15 
 
 
816 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142674  hitchhiker  0.000763047 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2432  protein-glutamate O-methyltransferase  46.15 
 
 
807 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2316  protein-glutamate O-methyltransferase  46.15 
 
 
814 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2029  protein-glutamate O-methyltransferase  46.15 
 
 
833 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2194  hypothetical protein  46.6 
 
 
427 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2020  SrpA-related protein  49.52 
 
 
479 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.511866  normal  0.928419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2090  SrpA-related protein  43.48 
 
 
717 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1943  protein-glutamate O-methyltransferase  43.48 
 
 
740 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.63049  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2439  srpA-related protein  44.55 
 
 
716 aa  85.9  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1929  SrpA-related protein  45.22 
 
 
598 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1888  SrpA-related protein  42.61 
 
 
717 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528264  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2585  SrpA-related protein  41.94 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611843  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1783  hypothetical protein  46.79 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2089  SrpA-related protein  42.45 
 
 
465 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.885668  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0215  hypothetical protein  50.5 
 
 
346 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1777  SrpA-related protein  43.81 
 
 
467 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0135  hypothetical protein  41.04 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1538  hypothetical protein  43 
 
 
234 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.304444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0441  hypothetical protein  43.69 
 
 
241 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.947365  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0467  hypothetical protein  43.69 
 
 
234 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>