33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2439 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2439  srpA-related protein  100 
 
 		 716 aa  1435    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1888  SrpA-related protein  54.1 
 
 		 717 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2090  SrpA-related protein  55.1 
 
 		 717 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1943  protein-glutamate O-methyltransferase  52.7 
 
 		 740 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.63049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1929  SrpA-related protein  39.91 
 
 		 598 aa  361  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2432  protein-glutamate O-methyltransferase  45.09 
 
 		 807 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2316  protein-glutamate O-methyltransferase  42.57 
 
 		 814 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2031  SrpA-related protein  39.53 
 
 		 816 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142674  hitchhiker  0.000763047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2029  protein-glutamate O-methyltransferase  45.21 
 
 		 833 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2585  SrpA-related protein  49.52 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611843  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2020  SrpA-related protein  42.16 
 
 		 479 aa  194  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.511866  normal  0.928419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1777  SrpA-related protein  41.18 
 
 		 467 aa  189  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2089  SrpA-related protein  53.11 
 
 		 465 aa  187  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.885668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1853  hypothetical protein  40 
 
 		 594 aa  164  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2194  hypothetical protein  55.22 
 
 		 427 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4228  hypothetical protein  55.05 
 
 		 333 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03991  hypothetical protein  54.63 
 
 		 327 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2751  hypothetical protein  56.31 
 
 		 238 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00712374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4082  hypothetical protein  53.61 
 
 		 244 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0096  hypothetical protein  55.14 
 
 		 236 aa  107  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3133  hypothetical protein  45.8 
 
 		 300 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0215  hypothetical protein  50 
 
 		 346 aa  97.4  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0608  hypothetical protein  37.93 
 
 		 273 aa  93.6  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.195723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0518  hypothetical protein  49.51 
 
 		 296 aa  90.9  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0031  hypothetical protein  44.55 
 
 		 138 aa  86.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1783  hypothetical protein  47.2 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2219  hypothetical protein  43.1 
 
 		 210 aa  85.9  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0738  hypothetical protein  37.76 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00987053  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1787  hypothetical protein  40.8 
 
 		 193 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0135  hypothetical protein  47.12 
 
 		 216 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1538  hypothetical protein  51.96 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.304444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0441  hypothetical protein  52.48 
 
 		 241 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.947365  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0467  hypothetical protein  52.48 
 
 		 234 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>