20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1278 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1278  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  331  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1210  hypothetical protein  57.32 
 
 		 179 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1280  hypothetical protein  68.29 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1209  hypothetical protein  68.29 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0691759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3336  hypothetical protein  65.29 
 
 		 190 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3167  hypothetical protein  62.7 
 
 		 210 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0454654  hitchhiker  0.000351492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3009  hypothetical protein  62.7 
 
 		 216 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1354  hypothetical protein  62.7 
 
 		 204 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  unclonable  0.00000000000154213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3024  hypothetical protein  62.7 
 
 		 210 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1292  hypothetical protein  55.1 
 
 		 161 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1530  hypothetical protein  56.21 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0510637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1417  hypothetical protein  59.54 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.737063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1248  hypothetical protein  64.66 
 
 		 198 aa  153  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.935468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2378  hypothetical protein  50.66 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1104  hypothetical protein  61.16 
 
 		 201 aa  151  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0903  hypothetical protein  46.97 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04076  hypothetical protein  43.15 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04740  hypothetical protein  40.46 
 
 		 180 aa  97.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1338  hypothetical protein  40.5 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.923186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0938  hypothetical protein  36.43 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>