20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3009 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3009  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3167  hypothetical protein  92.13 
 
 
210 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0454654  hitchhiker  0.000351492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3024  hypothetical protein  92.13 
 
 
210 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1354  hypothetical protein  85.65 
 
 
204 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  unclonable  0.00000000000154213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1210  hypothetical protein  68.21 
 
 
179 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1280  hypothetical protein  86.67 
 
 
179 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1209  hypothetical protein  85.93 
 
 
179 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0691759  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3336  hypothetical protein  71.27 
 
 
190 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1292  hypothetical protein  61.85 
 
 
161 aa  218  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1104  hypothetical protein  58.27 
 
 
201 aa  181  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1278  hypothetical protein  62.7 
 
 
157 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2378  hypothetical protein  55.56 
 
 
156 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1530  hypothetical protein  61.59 
 
 
162 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0510637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1417  hypothetical protein  60 
 
 
177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.737063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1248  hypothetical protein  56.82 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.935468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0903  hypothetical protein  49.24 
 
 
165 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04076  hypothetical protein  45 
 
 
148 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04740  hypothetical protein  33.92 
 
 
180 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1338  hypothetical protein  35.56 
 
 
162 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.923186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0938  hypothetical protein  30.56 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>