20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1104 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1248  hypothetical protein  62.69 
 
 		 198 aa  269  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.935468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3167  hypothetical protein  58.27 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0454654  hitchhiker  0.000351492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3009  hypothetical protein  58.27 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1354  hypothetical protein  58.27 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  unclonable  0.00000000000154213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3024  hypothetical protein  62.2 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1210  hypothetical protein  60.48 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1209  hypothetical protein  60.48 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0691759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1280  hypothetical protein  60.48 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3336  hypothetical protein  63.25 
 
 		 190 aa  168  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1292  hypothetical protein  58.73 
 
 		 161 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2378  hypothetical protein  53.68 
 
 		 156 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1530  hypothetical protein  54.41 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0510637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1417  hypothetical protein  54.55 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.737063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1278  hypothetical protein  61.16 
 
 		 157 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0903  hypothetical protein  42.54 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04076  hypothetical protein  42.11 
 
 		 148 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04740  hypothetical protein  36.22 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1338  hypothetical protein  31.3 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.923186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0938  hypothetical protein  34.75 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>