20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2378 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2378  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1292  hypothetical protein  50.33 
 
 		 161 aa  176  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3167  hypothetical protein  52.94 
 
 		 210 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0454654  hitchhiker  0.000351492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1354  hypothetical protein  56.35 
 
 		 204 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  unclonable  0.00000000000154213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3024  hypothetical protein  52.94 
 
 		 210 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3009  hypothetical protein  55.56 
 
 		 216 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1210  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1209  hypothetical protein  54.2 
 
 		 179 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0691759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1280  hypothetical protein  54.2 
 
 		 179 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3336  hypothetical protein  56.78 
 
 		 190 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1104  hypothetical protein  53.68 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1248  hypothetical protein  53.68 
 
 		 198 aa  158  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.935468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1278  hypothetical protein  50.66 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1417  hypothetical protein  48.05 
 
 		 177 aa  150  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.737063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1530  hypothetical protein  47.59 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0510637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0903  hypothetical protein  42.59 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04076  hypothetical protein  44.52 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04740  hypothetical protein  35.44 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1338  hypothetical protein  38.71 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.923186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0938  hypothetical protein  33.74 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>