28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06140  DMSO reductase anchor subunit  100 
 
 		 303 aa  597  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3029  hypothetical protein  39.6 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0469  hypothetical protein  40.2 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22760  DMSO reductase anchor subunit  38.61 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27330  hypothetical protein  37.33 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0499  hypothetical protein  38.41 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.405483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0517  hypothetical protein  39.62 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.403462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0509  hypothetical protein  38.54 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.649169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0513  hypothetical protein  39.3 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.63871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0503  hypothetical protein  37.26 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16870  hypothetical protein  33.56 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  30.28 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0609  hypothetical protein  29.7 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2766  DMSO reductase anchor subunit-like protein  29.61 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.740952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1599  DMSO reductase anchor subunit-like protein  27.21 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.12 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.04 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.04 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.04 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  26.75 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.04 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  27.04 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.04 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.04 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  27.04 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  29.27 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  28.66 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  28.66 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>