15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_27330  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0469  hypothetical protein  58.13 
 
 
289 aa  347  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3029  hypothetical protein  35.12 
 
 
299 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22760  DMSO reductase anchor subunit  39.33 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0499  hypothetical protein  39.29 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.405483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0509  hypothetical protein  39.61 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.649169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0517  hypothetical protein  39.22 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.403462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0513  hypothetical protein  39.22 
 
 
300 aa  145  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.63871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16870  hypothetical protein  32.66 
 
 
289 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06140  DMSO reductase anchor subunit  37.58 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0503  hypothetical protein  37.99 
 
 
301 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2766  DMSO reductase anchor subunit-like protein  30.07 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.740952 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0609  hypothetical protein  30.48 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  26.04 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1599  DMSO reductase anchor subunit-like protein  27.54 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>