20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1148 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  100 
 
 		 137 aa  291  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  60.14 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  47.41 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  44.44 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  43.7 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  44.85 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  44.53 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  40.74 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  39.86 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  42.34 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  39.2 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  34.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  39.62 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  34.62 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  35.2 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  41.18 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  32 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  31.52 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  25.55 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>