22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1707 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  242  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  40.17 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  39.47 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  33.06 
 
 
188 aa  67  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  34.82 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  36.05 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  31.62 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  40.74 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  32.23 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  38.96 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  31.52 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  32.14 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  36.14 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  26.61 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  34.41 
 
 
147 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  35 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  28.81 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  32.53 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  32.53 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>