22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1777 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  100 
 
 		 126 aa  269  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  90.48 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  76.19 
 
 		 126 aa  221  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  59.52 
 
 		 126 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  58.73 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  53.44 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  49.6 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  47.29 
 
 		 129 aa  140  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  44.85 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  40.97 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  43.16 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  37.29 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  35.83 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  47.44 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  38.94 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  37.65 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  37.21 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  32.04 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  35 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  30.16 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  27.01 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  28.12 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>