22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1847 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  100 
 
 
120 aa  253  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  53.21 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  47.11 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  45.16 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  43.33 
 
 
126 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  43.1 
 
 
134 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  39.17 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  37.1 
 
 
129 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  38.46 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  39.82 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  47.5 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  34.62 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  38.14 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  39.34 
 
 
128 aa  84  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  38.94 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  38.94 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  32.76 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  32.81 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  28.99 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  32.14 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  29.63 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  27.73 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>