22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1946 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  267  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  60.32 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  46.61 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  44.09 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  45.24 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  59.76 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  39.17 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 126 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  33.59 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  36.13 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  33.61 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  33.58 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  35.83 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  35.2 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  32.5 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  28.47 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  26.61 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  24.22 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  32.03 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  26.74 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>