21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0039 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  275  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  60.66 
 
 
121 aa  154  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  68.18 
 
 
131 aa  140  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  48.41 
 
 
126 aa  134  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  44.09 
 
 
126 aa  123  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  63.53 
 
 
126 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  47.11 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  41.53 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  37.7 
 
 
126 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  35.61 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  36.44 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  37.4 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  34.11 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  37.29 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  34.04 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  35.43 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  33.87 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  31.62 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  31.39 
 
 
188 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  29.31 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  29.92 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>