22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0237 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  100 
 
 		 139 aa  296  6e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  60.32 
 
 		 126 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  61.11 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  58.73 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  53.91 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  55.38 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  52.76 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  49.59 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  47.41 
 
 		 137 aa  140  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  43.24 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  45.65 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  47.62 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  37.4 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  36.13 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  38.14 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  36.44 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  41.18 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  40.74 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  34 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  29.75 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  34.68 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>