22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0705 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  69.09 
 
 		 131 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  60.66 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  51.64 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  46.61 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  50.88 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  56.25 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  42.02 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  37.41 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  39.06 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  37.07 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  37.17 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  52.56 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  34.78 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  37.07 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  36.21 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  32.46 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  29.29 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  33.71 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  32.81 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>