19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1145 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  54.49 
 
 
163 aa  174  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  44.71 
 
 
189 aa  150  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  39.76 
 
 
196 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  43.75 
 
 
176 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  39.64 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  33.52 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  36.02 
 
 
173 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  32.78 
 
 
175 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  32.6 
 
 
179 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  28.1 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  28.45 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  29.41 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  42.65 
 
 
286 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  25.56 
 
 
288 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  26.92 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  31.08 
 
 
286 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  26.58 
 
 
288 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>