16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2314 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  54.41 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  45.39 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0135  hypothetical protein  42.95 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000621154  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  41.06 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  40.26 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  37.01 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  29.59 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  28.1 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  29.38 
 
 		 173 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  26.95 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  29.29 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  25.6 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  29.6 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  22.98 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  29.69 
 
 		 175 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>