22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1850 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  345  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  45.39 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0135  hypothetical protein  36.67 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000621154  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  38.41 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  39.1 
 
 		 136 aa  94.7  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  26.28 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  26.58 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  28.45 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  31.62 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  30.63 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  25.32 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  24.7 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  22.82 
 
 		 181 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  22.44 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5401  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 470 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4791  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 464 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4885  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 491 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3481  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 491 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.679234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4265  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 485 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0310844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>