15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0269 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  361  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  39.64 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  36.2 
 
 
196 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  37.2 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  35.8 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  34.91 
 
 
173 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  30.23 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  29.76 
 
 
176 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  28.39 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  30.56 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  24.18 
 
 
147 aa  51.6  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  22.44 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  24.03 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  35.06 
 
 
286 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>