14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0255 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  38.46 
 
 
178 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  36.14 
 
 
163 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  36.2 
 
 
172 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  33.91 
 
 
176 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  33.91 
 
 
181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  34.3 
 
 
173 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  33.14 
 
 
179 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  33.76 
 
 
175 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  26.58 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
288 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  22.98 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  28.87 
 
 
136 aa  42.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>