16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2270 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  359  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  53.14 
 
 
181 aa  205  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  44.57 
 
 
179 aa  163  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  43.75 
 
 
178 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  38.37 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  32.61 
 
 
175 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  35.19 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  39.49 
 
 
163 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  33.14 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  29.76 
 
 
172 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  24.7 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  25.6 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  27.87 
 
 
136 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 
288 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 
288 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  22.7 
 
 
148 aa  40.8  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>